Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn2Q6PHP6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn2Q6PHP6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms