Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NeblQ0II04 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NeblQ0II04 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NeblQ0II04 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms