Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Crisp1Q03401 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Crisp1Q03401 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Crisp1Q03401 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms