Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gfra1P97785 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gfra1P97785 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms