Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf239P24399 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf239P24399 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms