Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B2mP01887 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
B2mP01887 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B2mP01887 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B2mP01887 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B2mP01887 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B2mP01887 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B2mP01887 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B2mP01887 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B2mP01887 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B2mP01887 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B2mP01887 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B2mP01887 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B2mP01887 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B2mP01887 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B2mP01887 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B2mP01887 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B2mP01887 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B2mP01887 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B2mP01887 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B2mP01887 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B2mP01887 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B2mP01887 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B2mP01887 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B2mP01887 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B2mP01887 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B2mP01887 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
B2mP01887 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms