Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20825J3QM67 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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