Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndrg3Q9QYF9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ndrg3Q9QYF9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ndrg3Q9QYF9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.7 ms