Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIY8

Cml3, Probable N-acetyltransferase CML3, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml3Q9JIY8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cml3Q9JIY8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cml3Q9JIY8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms