Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Prpf4Q9DAW6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prpf4Q9DAW6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prpf4Q9DAW6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms