Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nol3Q9D1X0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nol3Q9D1X0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms