Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkrip1Q9CWV6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkrip1Q9CWV6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms