Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cldn17Q8BXA6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn17Q8BXA6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn17Q8BXA6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms