Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rph3alQ768S4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rph3alQ768S4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rph3alQ768S4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms