Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd28Q505D1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ankrd28Q505D1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms