Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim15Q3UTD9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms