Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cib3Q0P523 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cib3Q0P523 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms