Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gria1P23818 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gria1P23818 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gria1P23818 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gria1P23818 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms