Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem200cJ3QK46 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem200cJ3QK46 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem200cJ3QK46 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms