Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Svep1A2AVA0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Svep1A2AVA0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Svep1A2AVA0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms