Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Irx6Q9ER75 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Irx6Q9ER75 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Irx6Q9ER75 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms