Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp2c55Q9D816 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp2c55Q9D816 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp2c55Q9D816 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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