Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D4W2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D4W2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D4W2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9D4W2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D4W2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D4W2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D4W2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms