Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChtopQ9CY57 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChtopQ9CY57 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.3 ms