Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ssh3Q8K330 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ssh3Q8K330 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ssh3Q8K330 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms