Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1I3

KICSTOR complex protein C12orf66 homolog, mousemouse

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P1I3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms