Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1I3

KICSTOR complex protein C12orf66 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P1I3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q6P1I3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q6P1I3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q6P1I3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q6P1I3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms