Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ggnbp1Q6K1E7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ggnbp1Q6K1E7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms