Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dusp27Q148W8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Dusp27Q148W8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dusp27Q148W8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Dusp27Q148W8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dusp27Q148W8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.7 ms