Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddr1Q03146 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddr1Q03146 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms