Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp10Q000W5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gbp10Q000W5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms