Protein–RNA interactions for Protein: P19788

Mgp, Matrix Gla protein, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MgpP19788 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MgpP19788 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MgpP19788 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MgpP19788 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MgpP19788 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MgpP19788 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MgpP19788 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MgpP19788 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MgpP19788 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MgpP19788 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MgpP19788 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MgpP19788 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MgpP19788 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MgpP19788 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MgpP19788 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MgpP19788 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MgpP19788 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MgpP19788 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MgpP19788 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MgpP19788 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MgpP19788 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MgpP19788 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MgpP19788 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MgpP19788 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MgpP19788 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MgpP19788 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MgpP19788 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MgpP19788 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MgpP19788 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MgpP19788 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MgpP19788 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MgpP19788 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MgpP19788 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MgpP19788 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MgpP19788 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MgpP19788 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MgpP19788 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms