Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01787 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01787 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01787 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01787 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01787 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01787 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01787 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01787 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01787 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01787 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01787 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01787 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01787 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01787 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01787 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01787 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms