Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kif3cO35066 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kif3cO35066 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kif3cO35066 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms