Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpb1B2RS76 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpb1B2RS76 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpb1B2RS76 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms