Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fip1l1Q9D824 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fip1l1Q9D824 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fip1l1Q9D824 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms