Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrtm1Q8K377 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm1Q8K377 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm1Q8K377 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms