Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brd2Q7JJ13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Brd2Q7JJ13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brd2Q7JJ13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms