Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fnip1Q68FD7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fnip1Q68FD7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fnip1Q68FD7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fnip1Q68FD7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fnip1Q68FD7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fnip1Q68FD7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms