Protein–RNA interactions for Protein: Q62011

Pdpn, Podoplanin, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdpnQ62011 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdpnQ62011 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdpnQ62011 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdpnQ62011 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms