Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctf1Q60753 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctf1Q60753 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctf1Q60753 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms