Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga4Q3UW12 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga4Q3UW12 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga4Q3UW12 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.6 ms