Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 IMP3YHR148W 552 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 ALB1YJL122W 528 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YAR069CYAR069C 294 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 AIM34YMR003W 597 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YOR072WYOR072W 315 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YPL191CYPL191C 1083 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 MET16YPR167C 786 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SMX3YPR182W 261 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YLR072WYLR072W 2082 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 FET5YFL041W 1869 nt7.45□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 BSC5YNR069C 1470 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RSA4YCR072C 1548 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YER137CYER137C 447 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RNA15YGL044C 891 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 NCS6YGL211W 1080 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YIL082WYIL082W 873 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 GCV3YAL044C 513 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 NYV1YLR093C 762 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RPL43AYPR043W 279 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SLS1YLR139C 1932 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 NOB1YOR056C 1380 nt7.44□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SHM1YBR263W 1473 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YMR279CYMR279C 1623 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 snR84snR84 550 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RTR1YER139C 681 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YER186CYER186C 921 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YHL018WYHL018W 363 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SPO7YAL009W 780 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YLR156WYLR156W 345 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YLR159WYLR159W 345 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YLR161WYLR161W 345 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 PFK27YOL136C 1194 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SPS4YOR313C 1017 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 MUD1YBR119W 897 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 DFG5YMR238W 1377 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 DRS1YLL008W 2259 nt7.43□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YGL132WYGL132W 336 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 PEX14YGL153W 1026 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YLR049CYLR049C 1287 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 ECM19YLR390W 339 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 ATG16YMR159C 453 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 ROX3YBL093C 663 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 TPT1YOL102C 693 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 ELC1YPL046C 300 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SUR1YPL057C 1149 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YAH1YPL252C 519 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YPL261CYPL261C 309 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RPL21AYBR191W 483 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SPS22YCL048W 1392 nt7.42□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 BMH2YDR099W 822 nt7.41□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 ARD1YHR013C 717 nt7.41□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RCN1YKL159C 636 nt7.41□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SPC2YML055W 537 nt7.41□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 AVT2YEL064C 1443 nt7.41□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 TAH18YPR048W 1872 nt7.41□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RGT2YDL138W 2292 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RVS161YCR009C 798 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 SLU7YDR088C 1149 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 HGH1YGR187C 1185 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 CUP1-1YHR053C 186 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 CUP1-2YHR055C 186 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 AIM18YHR198C 966 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 MBR1YKL093W 1020 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 PML39YML107C 1005 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 LTO1YNL260C 597 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 PNG1YPL096W 1092 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 MTH1YDR277C 1302 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 YPR196WYPR196W 1413 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 RIT1YMR283C 1542 nt7.4□□□□□ -1.22
SRF1Q12516 ECM10YEL030W 1935 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YDR514CYDR514C 1452 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 COM2YER130C 1332 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 RCR2YDR003W 633 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 AAD6YFL056C 639 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 ERV14YGL054C 417 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 HAP2YGL237C 798 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YGR114CYGR114C 390 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 PRP21YJL203W 843 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YLR334CYLR334C 381 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 MIC27YNL100W 705 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 PDR16YNL231C 1056 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 GLO4YOR040W 858 nt7.39□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YDR249CYDR249C 1122 nt7.38□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YJR157WYJR157W 363 nt7.38□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 NBP1YLR457C 960 nt7.38□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YMR010WYMR010W 1218 nt7.38□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 ECM13YBL043W 774 nt7.38□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 GAL7YBR018C 1101 nt7.38□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 FDH1YOR388C 1131 nt7.38□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 STE50YCL032W 1041 nt7.38□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 BI3Q0115 1554 nt7.37□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 WTM1YOR230W 1314 nt7.37□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 CRD1YDL142C 852 nt7.37□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.37□□□□□ -1.23
SRF1Q12516 YRB2YIL063C 984 nt7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 116.1 ms