Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha4Q03137 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Epha4Q03137 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms