Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Msr1P30204 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msr1P30204 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msr1P30204 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msr1P30204 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms