Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mfsd4b4J3QNS5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mfsd4b4J3QNS5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms