Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a18J3QN01 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a18J3QN01 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a18J3QN01 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms