Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 STX16-216ENST00000483434 874 ntTSL 313.49□□□□□ -0.257e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.377e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-211ENST00000460655 572 ntTSL 412.59□□□□□ -0.397e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.47e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-220ENST00000496117 528 ntTSL 510.95□□□□□ -0.667e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.727e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 MST1-208ENST00000484144 878 ntTSL 217.33■□□□□ 0.361e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 MST1-217ENST00000493836 923 ntTSL 213.38□□□□□ -0.271e-15■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.141e-10■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 55.49□□□□□ -1.531e-10■□□□□ 8.4
PRPF4O43172 MST1-221ENST00000498021 854 ntTSL 213.98□□□□□ -0.176e-8■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 MST1-207ENST00000481930 565 ntTSL 513.82□□□□□ -0.26e-8■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 324.61■■□□□ 1.534e-8■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-214ENST00000528652 519 ntTSL 318.33■□□□□ 0.523e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.484e-8■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-221ENST00000532247 1381 ntTSL 1 (best)16.59■□□□□ 0.253e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-228ENST00000548807 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.77■□□□□ 0.123e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.13e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-209ENST00000525228 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.64■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-210ENST00000525377 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.02■□□□□ -03e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -03e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -03e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -03e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.023e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 GRB7-206ENST00000461756 554 ntTSL 313.97□□□□□ -0.174e-8■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 312.48□□□□□ -0.414e-8■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 IL32-225ENST00000548246 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 58.38□□□□□ -1.074e-8■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PLCG1-216ENST00000608885 865 ntTSL 57.97□□□□□ -1.134e-8■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PLCG1-218ENST00000609821 570 ntTSL 56.14□□□□□ -1.434e-8■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-7■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 RPS19-203ENST00000598261 307 ntTSL 311.47□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ORC4-205ENST00000457954 647 ntTSL 410.83□□□□□ -0.681e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ORC4-212ENST00000495601 611 ntTSL 210.05□□□□□ -0.81e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.641e-7■□□□□ 8.3
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PRPF4O43172 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.661e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ORC4-203ENST00000416719 571 ntTSL 33.49□□□□□ -1.851e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.195e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.035e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.35e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-214ENST00000483795 1913 ntTSL 216.3■□□□□ 0.25e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-215ENST00000484735 540 ntTSL 315.91■□□□□ 0.145e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-209ENST00000464228 861 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.085e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-208ENST00000463190 570 ntTSL 215.2■□□□□ 0.025e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-220ENST00000497031 560 ntTSL 314.89□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-217ENST00000490426 1027 ntTSL 214.46□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ITGB1BP1-221ENST00000497105 659 ntTSL 311.29□□□□□ -0.65e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.342e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.322e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 321.41■■□□□ 1.022e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.863e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 219.67■□□□□ 0.742e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 EIF3B-212ENST00000494658 637 ntTSL 216.57■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 8.3
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