Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsc22d3Q9Z2S7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms