Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3Q9QZS0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3Q9QZS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms