Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc2lQ9JME7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2lQ9JME7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc2lQ9JME7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms